一是江河污染严重。水蛭生长于江河、湖泊、水溪、沟河及水田中，由于江河污染严重，加之水田连年大量施用农药、化肥，导致水蛭难以繁衍和生长，大量死亡，部分产区已趋灭绝，每年因此减产30%以上。
二是生长环境改变。主产区为了发展地方经济，连年大规模地开矿、修路、建厂、建房、开荒植树以及开发工业园区和旅游区等多种人类活动，使水蛭赖以生存的环境遭到严重破坏，水蛭无生存之地，目前主产区江河湖泊已少见成群的水蛭存在。
三是各地“竭泽而渔”。水蛭价格连年上涨，1千克干品水蛭可以卖几百元，捕捞水蛭的收入大大超过生产粮食和蔬菜。高利润刺激了产区群众捕捉水蛭的积极性，每逢产新期，一哄而上，无节制地滥捕滥捉，无论大小水蛭，一律“竭泽而渔”，影响了水蛭繁殖。
四是用量大幅增加。我国老年人口增多，患心脑血管疾病的人群逐年上升，以水蛭为主要原料生产的新药、特药和中成药数量与日俱增，所需水蛭原料已超过上世纪80~90年代的几十倍。
五是人工养殖滞后。人工养殖已进行了10年，但技术难关始终没有突破，水蛭生长缓慢、死亡率高，许多产区纷纷弃养，各地不见商品水蛭上市。
