水蛭养殖过程中，因天气的异常，如降温、长时间降雨、风向突然转变、冷热温差大等，或由于水体某些营养的缺乏，造成水体中藻类突然出现大规模死亡的现象，俗称“倒藻”。
倒藻会导致水色骤变。在养殖初期发生倒藻后，水体会变清，透明度大，并导致青苔、泥皮生长；在养殖中后期发生倒藻则会导致水体浑浊，变红发黑。
总而言之，气温突变、营养失衡，以及饲养管理不当，如底脏引发水粘导致水体缺氧，或换水量过大、消毒药用量与时间不妥等都会造成倒藻。
倒藻的危害：
一、倒藻会造成溶解氧下降，二氧化碳增加。这是由于倒藻后，导致水中缺乏进行光合作用的藻类，而且大量死藻的分解也会消耗大量氧气，从而使pH值迅速下降，一般会在7.5以下，严重影响水蛭血液的携氧力。
二、倒藻造成氨氮和亚硝酸盐增加，特别是遇上阴雨天时更明显。这是因为倒藻造成的死藻分解产生大量的氨氮和亚硝酸盐，而池塘本身的自净能力主要就是依赖藻类在氨氮循环中吸收、利用氨氮，并加快氮的循环，倒藻则造成这种能力减弱，进而导致水体的氨氮与亚硝酸盐不断积累、超标。
三、倒藻还会诱发水体中的有害细菌大量繁殖，增加水蛭的发病率。
四、倒藻造成的藻类突然死亡会释放出大量的藻毒，导致水蛭中毒、发病、死亡等。
做好预防措施，有效防止倒藻发生：
一、高温季节多开氧机预防水分层，保持充足的溶解氧，防止因缺氧引起的倒藻。
二、经常使用【蛭草安】，补充水草生长激活因子，补充水草生长所需养分，以满足藻类生长需求。
三、使用【蛭水肥】，本品中含有藻类细胞激活素，促进生长，为藻类提供营养源及活力，有利于防止藻类老化及倒藻。
发生倒藻时的应对措施：
一、首先查找导致倒藻的原因。是因水发粘亚缺氧造成的？或是因营养不均？还是由于水分层、底败等原因造成？只有找出原因，才能有针对性去处理抑制藻类生长的因子，然后再培藻。切忌盲目施肥和乱用活菌。若因水体缺氧引起的倒藻，如果不当使用活菌，反而会加剧水体缺氧或水发粘引起的倒藻；如果盲目追肥，则会造成水更粘导致水返清、肥沉底。
二、倒藻后应加大增氧力度，防止因倒藻产生缺氧应激，特别是在水蛭养殖中后期，最好多用改底增氧的产品，如【蛭底康】【蛭底爽】【蛭氧多】等。
三、如果有条件就适量换水改善水质，改善水环境以利于下一步的培藻。
四、用【蛭水肥】及【蛭草安】补充水体的生物酶、维生素以及氮磷钾等藻类无机、有机营养，促进有益藻类生长。
