水蛭交配的时间大多数在清晨，喜欢躲在水边石块或杂物下面进行。交配时头端相反，腹面紧贴在一起，使各自的雄性器官正好对着对方的雌性生殖孔，然后雄性生殖孔伸出细丝状的阴茎插人对方的雌性生殖孔内，并输出精子进入受精囊。水蛭交配时间一般持续1〜2小时。
当然，水蛭的品种不同，其受精方式也有差异。有的无阴茎，如舌蛭科、鱼蛭科和石蛭科等，它们交配时是把由精管膨腔分泌的包着精子的精荚埋到对方皮下，传送精子给对方。水蛭在交配时，极易受惊扰，稍有动静，两只正在交配的水蛭就可能迅速分开，造成交配失败或交配不充分。因此，在水蛭交配的季节，尤其在清晨，要保持安静，特别是对养殖池水面不要有太大的动作，以防正在交配的水蛭受到惊吓。
交配后过一段时间开始产卵，产卵时身体前段肌肉缓慢地不断收缩，雌性生殖孔开始也缓慢地排出一些透明的粘液小泡，随着粘液小泡变多，把生殖环带区绕成一圈，最后排出一些黄色粘液（精液），排完后，生殖环宽区变小，身体前段向后退缩，而排出的卵袋表面粘液固定不动。用前吸盘把卵袋的小孔封住，就完成产卵过程。
