水蛭是雌雄同体的动物，雄性生殖器官先成熟, 雌性生殖器官后成熟，行异体受精。雄性生殖器官， 种类不同，精巢数目不同，水蛭通常有 4~11对精巢，而无吻蛭目医蛭科的种类则只有10 对精巢，都分节排列在环带后区各囊、盲囊之间。 精巢实际上是小的体腔囊，每个精囊通过一短的输 出管与同側的输精管相连接。这对大管纵行于身体两侧并在前面各 自膨大或盘曲成精囊，再通过后 面较细的射精管转向中央汇合到 外胚层内榷成的精管膨腔上，最后由雄孔 开口于体外。
交配时两条水姪的腹面紧貼，头部方向相反, 一个个体的阴茎插人另一个个体的阴道中，进行稍 子传递。有些种类没有阴茎，如舌姪科、鱼姪科和石蛭科的种类，受梢时是将装有精子的精荚插入另一个个体的皮肤，精子再通过组织迁移至卵巢，完
精荚外有几丁质的包膜，通常由两个多少粘连 在一起的棍棒状管组成，其前面逐渐变细并有一钝 顶。在舌蛭科中，精荚插在身体任何部分对受精均 有效，而在鱼蛭科和石蛭科中，精荚必须插在环带 腹面方可受精，这是因为交配区下的一块叫输导组 织的纤维结缔组织块使精荚释放出的精子容易通过 并直接进入卵巢囊。雄性生殖器官是由一对卵巢裹及卵集鏟包含的卵巢组成。它们在前面伸出输卵管，并汇合成一肌 肉性的总输卵管，再经阴道和雌孔开口向外。在生殖季节卵囊的长度和体积都增大，总输卵管外常包有蛋白腺。在医蛭科牛蛭属中阴道又分成阴道盲囊和阴道管两个部分，有的种类输卵管与阴道管共同开口于阴道盲囊上，如湖北牛蛭，有的种类共同开口于一短而稍宽阔的盲襄，如棒纹牛蛭和菲牛蛭, 或共同开口于阴道盲囊伸出的阴道柄上，如颗粒牛蛭。
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